Godzilla është kthyer në një kujtim të largët për Japoninë kur shkatërrimi i një nëndetëse amerikane ngre alarmin për Admiralin Tachibana. Vajza e tij e larguar Yuri heton legjendën e përbindëshave mbrojtës, të cilët duhet të ngrihen për të mbrojtur Japoninë kundër shpirtrave hakmarrës brenda Godzilla që kërkojnë të shkatërrojnë kombin dhe popullin e tij për vuajtjet që shkaktuan në konfliktin e Paqësorit.